โรงเก็บเมล็ดพันธุ์ ต้องมีคุณลักษณะพิเศษกว่าโรงเก็บสินค้าทั่วไป เพราะเมล็ดพันธุ์เป็นสิ่งมีชีวิต โรงเก็บเมล็ดพันธุ์ต้องมีสภาพที่เหมาะสม มั่นคงแข็งแรง โดยมีลักษณะ ดังนี้

1. พื้นที่จัดเก็บมีความราบเรียบสม่ำเสมอ สามารถทนน้ำหนักเมล็ดพันธุ์ที่กดทับได้

2. โรงเก็บต้องป้องกันน้ำได้ ไม่ว่าจะเป็นการสาดจากน้ำฝน น้ำไหลท่วมจากภายนอกอาคาร หรือน้ำซึมผ่านจากใต้ดิน

3. มีการระบายอากาศที่ดี มีการติดตั้งพัดลมดูดอากาศ ให้มีอากาศหมุนเวียนถ่านเทภายในโรงเก็บ

4. โรงเก็บควรสร้างให้แข็งแรงมิดชิด เพื่อป้องกันนก หนู และแมลง ที่สามารถเข้ามาทำลายเมล็ดพันธุ์ที่อยู่ภายใน

5. ทำความสะอาดโรงเก็บเป็นประจำ เพื่อเป็นภาพพจน์ที่ดีและช่วยลดการระบาดของนกหนูและแมลงต่างๆ

ข้อห้าม 7 ประการของการเก็บรักษาเมล็ดพันธุ์

1. ห้ามเก็บเมล็ดพันธุ์ที่ความชื้นสูง

2. ห้ามเก็บเมล็ดพันธุ์ไว้ใกล้กับปุ๋ยหรือสารเคมี เพราะจะมีผลโดยตรงกับความงอกเมล็ดพันธุ์

3. ห้ามเก็บเมล็ดพันธุ์ไว้ใกล้กับแหล่งน้ำ เพราะจะทำให้เมล็ดพันธุ์มีความชื้นสูง และอายุสั้น

4. ห้ามเก็บเมล็ดพันธุ์บนพื้นโดยตรง อากาศถ่ายเทไม่ดี เมล็ดพันธุ์จะเน่าเสียเร็ว

5. ห้ามให้มีศัตรูโรคแมลงขณะเก็บรักษา

6. ห้ามเก็บเมล็ดพันธุ์ที่ตายแล้ว

7. ห้ามละเลยการตรวจสอบเมล็ดพันธุ์ขณะเก็บรักษา